Voor de kerkelijke organen is de NKiD de Protestantse Gemeente te Duisburg-Ruhrort, behorende bij de classis Arnhem van de Protestantse Kerk in Nederland (PKN). De kerkorde van de PKN is voor haar bepalend. Gezien de bijzondere situatie van de NKiD is door de classis Arnhem wat betreft het vervullen van bepaalde voorwaarden uit de kerkorde ontheffing verleend (besluiten voorjaar 2004).
De NKiD is een "doorgangshuis" voor degenen, die later aansluiting zoeken bij de EKD en een kerkelijk "thuis" voor degenen, die dit om verschillende redenen niet doen. De NKiD is kerk en is geloofsgemeenschap. Ook al komen de leden uit verschillende kerken, de verschillen vormen geen hindernis om bij dat "thuis" of "doorgangshuis" te kunnen behoren. Wezenlijk is voor de NKiD, dat zij van Protestantse komaf is en juist vanwege haar thuis- en doorgangshuisfunctie oecumenisch is.
Leden zijn zij, die afkomstig zijn uit de PKN en zich hebben gemeld door middel van het inleveren van hun attestatie (Ord 2-5-4) en/of doordat zij te kennen hebben gegeven, te willen participeren in het kerkelijk leven van de NKiD.
Gastleden zijn zij, die leden zijn van kerken, waarmee de PKN bijzondere betrekkingen onderhoudt, èn leden van de EKD of van Kirchen in Duitsland die bij de ACK zijn aangesloten, en die te kennen hebben gegeven met de rechten van leden te willen participeren in het kerkelijk leven van de NKiD.
Tot de gemeenschap van de gemeente worden voorts gerekend degenen, die noch leden noch gastleden zijn, maar wel blijk geven van verbondenheid met de gemeente. Hiertoe behoren ook de niet-gedoopte kinderen van leden van de NKiD, mits de ouders geen bezwaar tegen registratie maken. Zij hebben door een besluit van de algemene kerkenraad de zelfde rechten en plichten gekregen als gastleden.
De registratie van leden en gastleden wordt verzorgd door het kerkelijk bureau.
De registratie van niet-gedoopte kinderen van leden en van hen die blijk geven van verbondenheid met de gemeente wordt eveneens door het kerkelijk bureau verzorgd, tenzij de betrokkenen hiertegen bezwaar maken. Betrokkenen wordt gevraagd of gegevens, die zij verstrekken aan de predikant of andere contactpersoon, geregistreerd mogen worden.
Bepaalde onderdelen van deze regeling baseren zich op de verdragen die in het voorjaar 2003 gesloten zijn: